Iličić, Renata

Link to this page

Authority KeyName Variants
ff718297-134a-4a80-840c-9b01bfba3282
  • Iličić, Renata (1)
Projects

Author's Bibliography

MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI

Jelušić, Aleksandra; Popović, Tatjana; Marković, Sanja; Blagojević, Milan; Bagi, Ferenc; Iličić, Renata

(Društvo za zaštitu bilja Srbije, 2021)

TY  - CONF
AU  - Jelušić, Aleksandra
AU  - Popović, Tatjana
AU  - Marković, Sanja
AU  - Blagojević, Milan
AU  - Bagi, Ferenc
AU  - Iličić, Renata
PY  - 2021
UR  - http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/1980
AB  - Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne 
pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri 
povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi 
zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum
prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj 
ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa 
obolelih listova trešnje i šljive.
U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive 
(lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize 
multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i 
rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane 
reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u 
trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C 
(gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i 
finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene 
sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu 
pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa 
trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne 
pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. 
syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi).
PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 
bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na 
veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih 
gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što 
ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu 
konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno 
sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. 
morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. 
Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su 
odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s.
pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, 
domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.
PB  - Društvo za zaštitu bilja Srbije
C3  - XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova
T1  - MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI
SP  - 45
UR  - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980
ER  - 
@conference{
author = "Jelušić, Aleksandra and Popović, Tatjana and Marković, Sanja and Blagojević, Milan and Bagi, Ferenc and Iličić, Renata",
year = "2021",
abstract = "Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne 
pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri 
povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi 
zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum
prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj 
ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa 
obolelih listova trešnje i šljive.
U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive 
(lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize 
multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i 
rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane 
reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u 
trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C 
(gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i 
finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene 
sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu 
pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa 
trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne 
pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. 
syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi).
PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 
bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na 
veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih 
gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što 
ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu 
konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno 
sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. 
morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. 
Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su 
odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s.
pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, 
domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja Srbije",
journal = "XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova",
title = "MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI",
pages = "45",
url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980"
}
Jelušić, A., Popović, T., Marković, S., Blagojević, M., Bagi, F.,& Iličić, R.. (2021). MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI. in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova
Društvo za zaštitu bilja Srbije., 45.
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980
Jelušić A, Popović T, Marković S, Blagojević M, Bagi F, Iličić R. MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI. in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova. 2021;:45.
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 .
Jelušić, Aleksandra, Popović, Tatjana, Marković, Sanja, Blagojević, Milan, Bagi, Ferenc, Iličić, Renata, "MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI" in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova (2021):45,
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 .