MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI
Само за регистроване кориснике
2021
Аутори
Jelušić, AleksandraPopović, Tatjana
Marković, Sanja
Blagojević, Milan
Bagi, Ferenc
Iličić, Renata
Конференцијски прилог (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne
pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri
povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi
zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum
prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj
ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa
obolelih listova trešnje i šljive.
U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive
(lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize
multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i
rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane
reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denatur...acija na 94 °C u
trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C
(gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i
finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene
sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu
pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa
trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne
pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv.
syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi).
PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610
bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na
veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih
gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što
ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu
konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno
sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv.
morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine.
Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su
odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s.
pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu,
domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.
Кључне речи:
bakteriozna pegavost listova i plodova / MLSA / rasa 1Извор:
XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova, 2021, 45-Издавач:
- Društvo za zaštitu bilja Srbije
Финансирање / пројекти:
- Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, институционално финансирање - 200117 (Универзитет у Новом Саду, Пољопривредни факултет) (RS-MESTD-inst-2020-200117)
- Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, институционално финансирање - 200010 (Институт за заштиту биља и животну средину, Београд) (RS-MESTD-inst-2020-200010)
- Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, институционално финансирање - 200053 (Универзитет у Београду, Институт за мултидисциплинарна истраживања) (RS-MESTD-inst-2020-200053)
Институција/група
Institut za multidisciplinarna istraživanjaTY - CONF AU - Jelušić, Aleksandra AU - Popović, Tatjana AU - Marković, Sanja AU - Blagojević, Milan AU - Bagi, Ferenc AU - Iličić, Renata PY - 2021 UR - http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/1980 AB - Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa obolelih listova trešnje i šljive. U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive (lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C (gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi). PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s. pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani. PB - Društvo za zaštitu bilja Srbije C3 - XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova T1 - MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI SP - 45 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 ER -
@conference{ author = "Jelušić, Aleksandra and Popović, Tatjana and Marković, Sanja and Blagojević, Milan and Bagi, Ferenc and Iličić, Renata", year = "2021", abstract = "Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa obolelih listova trešnje i šljive. U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive (lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C (gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi). PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s. pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.", publisher = "Društvo za zaštitu bilja Srbije", journal = "XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova", title = "MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI", pages = "45", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980" }
Jelušić, A., Popović, T., Marković, S., Blagojević, M., Bagi, F.,& Iličić, R.. (2021). MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI. in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova Društvo za zaštitu bilja Srbije., 45. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980
Jelušić A, Popović T, Marković S, Blagojević M, Bagi F, Iličić R. MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI. in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova. 2021;:45. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 .
Jelušić, Aleksandra, Popović, Tatjana, Marković, Sanja, Blagojević, Milan, Bagi, Ferenc, Iličić, Renata, "MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI" in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova (2021):45, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 .