RIMSI - Repository of Institute for Multidisciplinary Research
University of Belgrade - Institute for Multidisciplinary Research
    • English
    • Српски
    • Српски (Serbia)
  • English 
    • English
    • Serbian (Cyrillic)
    • Serbian (Latin)
  • Login
View Item 
  •   RIMSI
  • Institut za multidisciplinarna istraživanja
  • Doktorati
  • View Item
  •   RIMSI
  • Institut za multidisciplinarna istraživanja
  • Doktorati
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Uticaj ledenih doba na filogeografske obrasce šumskih ptica: Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris

Impact of ice ages on phylogeographic patterns of forest bird species: Phylloscopus collybita, Prunella modularis and Certhia familiaris

Thumbnail
2018
20.pdf (5.290Mb)
Authors
Raković, Marko
Mentor
Petrović, Anđeljko
Committee members
Skorić, Stefan
Plećaš, Milan
Doctoral thesis (Published version)
Metadata
Show full item record
Abstract
izolaciju populacija u refugijumima za vreme glacijalnih maksimuma, i nakon toga rekolonizaciju šireg dela Evropskog kontinenta za vreme povlačenja lednika. Da bi se ova paradigma testirala, analizirani su filogenetski obrasci unutar tri šumske vrste ptica (Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris) koje su rasprostranjene širom Evroazije. Obrasci geografske varijacije jednog mitohondrijalnog i jednog nuklearnog gena su analizirani kod običnog zviždka (P. collybita). Kod običnog popića (P. modularis) u istraživanjima je korišćen jedan mitohondrijalni gen i 10 nuklearnih gena, dok kod kratkokljunog puzića (C. familiaris) tri mitohondrijalna i tri nuklearna gena. Analiza mitohondrijalnog gena kod običnog zviždka je pokazala postojanje šest filogenetskih linija koje odgovaraju postojećim podvrstama. Kod običnog popića, analize mitohondrijalnog gena, kao i analize nuklearnih gena i razgraničavanja podvrsta su ukazale na postojanje tri odvojene evolutivne linije: jedna... je rasprostranjena na prostoru Pirinejskog poluostrva, druga na području Kavkaza i treća na području Apeninskog, Balkanskog poluostrva i ostatka Evrope. Kratkokljuni puzić se sastoji od dve filogenetske linije koje su se razdvojile u srednjem Pleistocenu: jedna paleoendemična koja ima alopatričko rasprostranjenje ograničeno na ostrvo Korzika i region Kavkaza i drugu, mlađu i široko rasprostranjenu, koja je prisutna u većem delu Evroazije i severnog dela Kine. Rezultati dobijeni u ovom istraživanju naglašavaju značaj glacijacija u oblikovanju evolucione istorije sve tri istraživane vrste ptica na prostoru Evroazije.

Hewitt’s paradigm for effects of Pleistocene glaciations on European populations assumes their isolation in peninsular refugia during glacial maxima, followed by recolonization of broader Europe during interstadials. To test this paradigm, we analyzed the phylogenetic relationships within three forest bird species (Phylloscopus collybita, Prunella modularis and Certhia familiaris) which ranges includes parts of Eurasia. For Common Chiffchaff (P. collybita) the patterns of intraspecific geographic variation in one mitochondrial and one nuclear gene were analyzed, for Dunnock (P. modularis) one mitochondrial and 10 nuclear genes and for Eurasian Treecreeper (C. familiaris) three mitochondrial and three nuclear genes. Common Chiffchaff subspecies were differentiated in their mtDNA, and formed six distinct mtDNA lineages. Regarding Dunnock, mtDNA gene tree, multilocus species tree and species delimitation analyses indicate the presence of three distinct lineages: one in the Iberian refugiu...m, one in the Caucasus refugium, and one comprising the Italian and Balkan refugia and broader Europe. Eurasian Treecreeper comprises of two lineages that diverged during the mid-Pleistocene: one palaeoendemic lineage has an allopatric range nowadays restricted to the Corsica Island and the Caucasus region whereas the second one, more recent and widespread, is distributed over most of Eurasia and in northern China. Results obtained in this study highlight the importance of glaciations in shaping the evolutionary history of these three forest bird species in Eurasia.

Keywords:
šumske vrste ptica / refugijumi / Prunella modularis / Phylloscopus collybita / nuklearni geni / mitohondrijalni geni / ledeno doba / filogeografija / Certhia familiaris / refugium / Prunella modularis / phylogeography / Phylloscopus collybita / nuclear genes / mitochondrial genes / ice age / forest bird species / Certhia familiaris
Source:
2018
Publisher:
  • Univerzitet u Beogradu, Biološki fakultet
[ Google Scholar ]
Handle
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_11741
URI
http://eteze.bg.ac.rs/application/showtheses?thesesId=7081
https://nardus.mpn.gov.rs/handle/123456789/11741
https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20719/bdef:Content/download
http://vbs.rs/scripts/cobiss?command=DISPLAY&base=70036&RID=1025226674
http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/23
Collections
  • Doktorati
Institution/Community
Institut za multidisciplinarna istraživanja
TY  - THES
AU  - Raković, Marko
PY  - 2018
UR  - http://eteze.bg.ac.rs/application/showtheses?thesesId=7081
UR  - https://nardus.mpn.gov.rs/handle/123456789/11741
UR  - https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20719/bdef:Content/download
UR  - http://vbs.rs/scripts/cobiss?command=DISPLAY&base=70036&RID=1025226674
UR  - http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/23
AB  - izolaciju populacija u refugijumima za vreme glacijalnih maksimuma, i nakon toga rekolonizaciju šireg dela Evropskog kontinenta za vreme povlačenja lednika. Da bi se ova paradigma testirala, analizirani su filogenetski obrasci unutar tri šumske vrste ptica (Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris) koje su rasprostranjene širom Evroazije. Obrasci geografske varijacije jednog mitohondrijalnog i jednog nuklearnog gena su analizirani kod običnog zviždka (P. collybita). Kod običnog popića (P. modularis) u istraživanjima je korišćen jedan mitohondrijalni gen i 10 nuklearnih gena, dok kod kratkokljunog puzića (C. familiaris) tri mitohondrijalna i tri nuklearna gena. Analiza mitohondrijalnog gena kod običnog zviždka je pokazala postojanje šest filogenetskih linija koje odgovaraju postojećim podvrstama. Kod običnog popića, analize mitohondrijalnog gena, kao i analize nuklearnih gena i razgraničavanja podvrsta su ukazale na postojanje tri odvojene evolutivne linije: jedna je rasprostranjena na prostoru Pirinejskog poluostrva, druga na području Kavkaza i treća na području Apeninskog, Balkanskog poluostrva i ostatka Evrope. Kratkokljuni puzić se sastoji od dve filogenetske linije koje su se razdvojile u srednjem Pleistocenu: jedna paleoendemična koja ima alopatričko rasprostranjenje ograničeno na ostrvo Korzika i region Kavkaza i drugu, mlađu i široko rasprostranjenu, koja je prisutna u većem delu Evroazije i severnog dela Kine. Rezultati dobijeni u ovom istraživanju naglašavaju značaj glacijacija u oblikovanju evolucione istorije sve tri istraživane vrste ptica na prostoru Evroazije.
AB  - Hewitt’s paradigm for effects of Pleistocene glaciations on European populations assumes their isolation in peninsular refugia during glacial maxima, followed by recolonization of broader Europe during interstadials. To test this paradigm, we analyzed the phylogenetic relationships within three forest bird species (Phylloscopus collybita, Prunella modularis and Certhia familiaris) which ranges includes parts of Eurasia. For Common Chiffchaff (P. collybita) the patterns of intraspecific geographic variation in one mitochondrial and one nuclear gene were analyzed, for Dunnock (P. modularis) one mitochondrial and 10 nuclear genes and for Eurasian Treecreeper (C. familiaris) three mitochondrial and three nuclear genes. Common Chiffchaff subspecies were differentiated in their mtDNA, and formed six distinct mtDNA lineages. Regarding Dunnock, mtDNA gene tree, multilocus species tree and species delimitation analyses indicate the presence of three distinct lineages: one in the Iberian refugium, one in the Caucasus refugium, and one comprising the Italian and Balkan refugia and broader Europe. Eurasian Treecreeper comprises of two lineages that diverged during the mid-Pleistocene: one palaeoendemic lineage has an allopatric range nowadays restricted to the Corsica Island and the Caucasus region whereas the second one, more recent and widespread, is distributed over most of Eurasia and in northern China. Results obtained in this study highlight the importance of glaciations in shaping the evolutionary history of these three forest bird species in Eurasia.
PB  - Univerzitet u Beogradu, Biološki fakultet
T1  - Uticaj ledenih doba na filogeografske obrasce šumskih ptica: Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris
T1  - Impact of ice ages on phylogeographic patterns of forest bird species: Phylloscopus collybita, Prunella modularis and Certhia familiaris
UR  - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_11741
ER  - 
@phdthesis{
author = "Raković, Marko",
year = "2018",
abstract = "izolaciju populacija u refugijumima za vreme glacijalnih maksimuma, i nakon toga rekolonizaciju šireg dela Evropskog kontinenta za vreme povlačenja lednika. Da bi se ova paradigma testirala, analizirani su filogenetski obrasci unutar tri šumske vrste ptica (Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris) koje su rasprostranjene širom Evroazije. Obrasci geografske varijacije jednog mitohondrijalnog i jednog nuklearnog gena su analizirani kod običnog zviždka (P. collybita). Kod običnog popića (P. modularis) u istraživanjima je korišćen jedan mitohondrijalni gen i 10 nuklearnih gena, dok kod kratkokljunog puzića (C. familiaris) tri mitohondrijalna i tri nuklearna gena. Analiza mitohondrijalnog gena kod običnog zviždka je pokazala postojanje šest filogenetskih linija koje odgovaraju postojećim podvrstama. Kod običnog popića, analize mitohondrijalnog gena, kao i analize nuklearnih gena i razgraničavanja podvrsta su ukazale na postojanje tri odvojene evolutivne linije: jedna je rasprostranjena na prostoru Pirinejskog poluostrva, druga na području Kavkaza i treća na području Apeninskog, Balkanskog poluostrva i ostatka Evrope. Kratkokljuni puzić se sastoji od dve filogenetske linije koje su se razdvojile u srednjem Pleistocenu: jedna paleoendemična koja ima alopatričko rasprostranjenje ograničeno na ostrvo Korzika i region Kavkaza i drugu, mlađu i široko rasprostranjenu, koja je prisutna u većem delu Evroazije i severnog dela Kine. Rezultati dobijeni u ovom istraživanju naglašavaju značaj glacijacija u oblikovanju evolucione istorije sve tri istraživane vrste ptica na prostoru Evroazije., Hewitt’s paradigm for effects of Pleistocene glaciations on European populations assumes their isolation in peninsular refugia during glacial maxima, followed by recolonization of broader Europe during interstadials. To test this paradigm, we analyzed the phylogenetic relationships within three forest bird species (Phylloscopus collybita, Prunella modularis and Certhia familiaris) which ranges includes parts of Eurasia. For Common Chiffchaff (P. collybita) the patterns of intraspecific geographic variation in one mitochondrial and one nuclear gene were analyzed, for Dunnock (P. modularis) one mitochondrial and 10 nuclear genes and for Eurasian Treecreeper (C. familiaris) three mitochondrial and three nuclear genes. Common Chiffchaff subspecies were differentiated in their mtDNA, and formed six distinct mtDNA lineages. Regarding Dunnock, mtDNA gene tree, multilocus species tree and species delimitation analyses indicate the presence of three distinct lineages: one in the Iberian refugium, one in the Caucasus refugium, and one comprising the Italian and Balkan refugia and broader Europe. Eurasian Treecreeper comprises of two lineages that diverged during the mid-Pleistocene: one palaeoendemic lineage has an allopatric range nowadays restricted to the Corsica Island and the Caucasus region whereas the second one, more recent and widespread, is distributed over most of Eurasia and in northern China. Results obtained in this study highlight the importance of glaciations in shaping the evolutionary history of these three forest bird species in Eurasia.",
publisher = "Univerzitet u Beogradu, Biološki fakultet",
title = "Uticaj ledenih doba na filogeografske obrasce šumskih ptica: Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris, Impact of ice ages on phylogeographic patterns of forest bird species: Phylloscopus collybita, Prunella modularis and Certhia familiaris",
url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_11741"
}
Raković, M.. (2018). Uticaj ledenih doba na filogeografske obrasce šumskih ptica: Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris. 
Univerzitet u Beogradu, Biološki fakultet..
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_11741
Raković M. Uticaj ledenih doba na filogeografske obrasce šumskih ptica: Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris. 2018;.
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_11741 .
Raković, Marko, "Uticaj ledenih doba na filogeografske obrasce šumskih ptica: Phylloscopus collybita, Prunella modularis i Certhia familiaris" (2018),
https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_11741 .

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
About RIMSI | Send Feedback

OpenAIRERCUB
 

 

All of DSpaceCommunitiesAuthorsTitlesSubjectsThis institutionAuthorsTitlesSubjects

Statistics

View Usage Statistics

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
About RIMSI | Send Feedback

OpenAIRERCUB