MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI
Authorized Users Only
2021
Authors
Jelušić, Aleksandra
Popović, Tatjana

Marković, Sanja

Blagojević, Milan
Bagi, Ferenc
Iličić, Renata
Conference object (Published version)

Metadata
Show full item recordAbstract
Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne
pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri
povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi
zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum
prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj
ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa
obolelih listova trešnje i šljive.
U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive
(lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize
multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i
rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane
reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denatur...acija na 94 °C u
trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C
(gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i
finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene
sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu
pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa
trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne
pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv.
syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi).
PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610
bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na
veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih
gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što
ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu
konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno
sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv.
morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine.
Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su
odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s.
pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu,
domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.
Keywords:
bakteriozna pegavost listova i plodova / MLSA / rasa 1Source:
XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova, 2021, 45-Publisher:
- Društvo za zaštitu bilja Srbije
Funding / projects:
- Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200117 (University of Novi Sad, Faculty of Agriculture) (RS-200117)
- Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200010 (Institute for Plant Protection and Environment, Belgrade) (RS-200010)
- Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200053 (University of Belgrade, Institute for Multidisciplinary Research) (RS-200053)
Collections
Institution/Community
Institut za multidisciplinarna istraživanjaTY - CONF AU - Jelušić, Aleksandra AU - Popović, Tatjana AU - Marković, Sanja AU - Blagojević, Milan AU - Bagi, Ferenc AU - Iličić, Renata PY - 2021 UR - http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/1980 AB - Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa obolelih listova trešnje i šljive. U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive (lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C (gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi). PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s. pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani. PB - Društvo za zaštitu bilja Srbije C3 - XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova T1 - MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI SP - 45 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 ER -
@conference{ author = "Jelušić, Aleksandra and Popović, Tatjana and Marković, Sanja and Blagojević, Milan and Bagi, Ferenc and Iličić, Renata", year = "2021", abstract = "Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa obolelih listova trešnje i šljive. U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive (lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C (gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi). PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s. pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.", publisher = "Društvo za zaštitu bilja Srbije", journal = "XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova", title = "MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI", pages = "45", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980" }
Jelušić, A., Popović, T., Marković, S., Blagojević, M., Bagi, F.,& Iličić, R.. (2021). MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI. in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova Društvo za zaštitu bilja Srbije., 45. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980
Jelušić A, Popović T, Marković S, Blagojević M, Bagi F, Iličić R. MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI. in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova. 2021;:45. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 .
Jelušić, Aleksandra, Popović, Tatjana, Marković, Sanja, Blagojević, Milan, Bagi, Ferenc, Iličić, Renata, "MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA Pseudomonas syringae pv. morsprunorum POREKLOM SA TREŠNJE I ŠLJIVE U SRBIJI" in XVI SIMPOZIJUM O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova (2021):45, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1980 .