Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis – NOVI PATOGEN KROMPIRA U SRBIJI
Authorized Users Only
2018
Authors
Popović, Tatjana
Marković, Sanja

Bijelić, Živojin
Iličić, Renata
Jelušić, Aleksandra

Stanković, Slaviša

Conference object (Published version)

Metadata
Show full item recordAbstract
Fitopatogene bakterije iz roda Pectobacterium (raniji naziv Erwinia carotovora) na monokoti ledonim i dikotiledonim biljkama prouzrokuju bolesti tipa vlažne truleži. Osim ovog simptoma, za
krompir je karakteristična i bolest opisana kao „crna noga” i uvenuće celih biljaka. U regionu Bačke
(Vojvodina) je tokom maja 2018. godine na merkantilnom usevu krompira (sorta Lady Claire) zapa žena pojava crne noge krompira sa intenzitetom zaraze 5-10%. Već tokom juna intenzitet zaraze se
povećao i iznosio je 40-45%. Početni simptomi bolesti su se ispoljavali u vidu uvelosti celih biljaka,
dok se vršno lišće uvijalo prema licu i nekrotiralo po rubovima. Kako je bolest napredovala potpunim
sušenjem vršnih listova i postepenim sušenjem donjeg lišća, na stablu je pri osnovi boja prelazila u
mrku do crnu, a prilikom uzdužnog preseka mogla se uočiti nekroza unutrašnjeg sprovodnog tkiva.
S obzirom na veoma izražen intenzitet zaraze, kao i veliki broj mogućih uzročnika koji izazivaju
slič...an tip oboljenja, cilj ovog istraživanja bio je detekcija i identifikacija prouzrokovača uvelosti
i crne noge krompira. Izolacija patogena je vršena na hranljive podloge NA (hranljivi agar) i KDA
(krompir-dekstrozni agar), iz biljnih delova (cima) dobijenih sa margina obolelog tkiva, potopljenih
i maceriranih u sterilnom fosfatnom puferu, u trajanju od 30 min. Nakon 48 sati, na podlogama su
se razvile okrugle i glatke, ispupčene, kremasto-prozirne bakterijske kolonije. Odabrani izolati su
gram-negativni, nefluorescentni, fakultativno-anaerobni, oksidaza negativni, katalaza pozitivni. Pek tolitički test je izveden na kriškama krompira (25°C tokom 48 sati), na kojima je već nakon 24 časa
dolazilo do propadanja tkiva uz prisustvo karakterističnog mirisa koji prati vlažnu trulež. Prema
dobijenim rezultatima, izolati su pokazali pripadnost rodu Pectobacterium. Detaljnija identifikacija
izolata vršena je sekvencioniranjem dva konzervativna gena, gapA i mdh, primenom PCR metode
sa parom prajmera gapA326F/gapA845R i mdh2/mdh4, tim redom. BLAST analiza je pokazala da
svi izolati pokazuju 100% (gapA) i 98% (mdh) homologiju sa Pectobacterium carotovorum subsp.
brasiliensis sojevima deponovanim u NCBI bazi. Rezultati ovog rada ukazuju na postojanje nove
podvrste bakterije Pectobacterium carotovorum u Srbiji, koja ranije, ukoliko je i bila prisutna, usled
nedostatka filogenetskih informacija do sada nije bila identifikovana i opisana.
Keywords:
Pectobacterium / identifikacija / krompirSource:
XV SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova, 2018, 23-Publisher:
- Društvo za zaštitu bilja Srbije
Funding / projects:
- Rad je podržan od strane Ministarstva prosvete, nauke i tehnološkog razvoja Republike Srbije (projekat III43010)
Collections
Institution/Community
Institut za multidisciplinarna istraživanjaTY - CONF AU - Popović, Tatjana AU - Marković, Sanja AU - Bijelić, Živojin AU - Iličić, Renata AU - Jelušić, Aleksandra AU - Stanković, Slaviša PY - 2018 UR - http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/1964 AB - Fitopatogene bakterije iz roda Pectobacterium (raniji naziv Erwinia carotovora) na monokoti ledonim i dikotiledonim biljkama prouzrokuju bolesti tipa vlažne truleži. Osim ovog simptoma, za krompir je karakteristična i bolest opisana kao „crna noga” i uvenuće celih biljaka. U regionu Bačke (Vojvodina) je tokom maja 2018. godine na merkantilnom usevu krompira (sorta Lady Claire) zapa žena pojava crne noge krompira sa intenzitetom zaraze 5-10%. Već tokom juna intenzitet zaraze se povećao i iznosio je 40-45%. Početni simptomi bolesti su se ispoljavali u vidu uvelosti celih biljaka, dok se vršno lišće uvijalo prema licu i nekrotiralo po rubovima. Kako je bolest napredovala potpunim sušenjem vršnih listova i postepenim sušenjem donjeg lišća, na stablu je pri osnovi boja prelazila u mrku do crnu, a prilikom uzdužnog preseka mogla se uočiti nekroza unutrašnjeg sprovodnog tkiva. S obzirom na veoma izražen intenzitet zaraze, kao i veliki broj mogućih uzročnika koji izazivaju sličan tip oboljenja, cilj ovog istraživanja bio je detekcija i identifikacija prouzrokovača uvelosti i crne noge krompira. Izolacija patogena je vršena na hranljive podloge NA (hranljivi agar) i KDA (krompir-dekstrozni agar), iz biljnih delova (cima) dobijenih sa margina obolelog tkiva, potopljenih i maceriranih u sterilnom fosfatnom puferu, u trajanju od 30 min. Nakon 48 sati, na podlogama su se razvile okrugle i glatke, ispupčene, kremasto-prozirne bakterijske kolonije. Odabrani izolati su gram-negativni, nefluorescentni, fakultativno-anaerobni, oksidaza negativni, katalaza pozitivni. Pek tolitički test je izveden na kriškama krompira (25°C tokom 48 sati), na kojima je već nakon 24 časa dolazilo do propadanja tkiva uz prisustvo karakterističnog mirisa koji prati vlažnu trulež. Prema dobijenim rezultatima, izolati su pokazali pripadnost rodu Pectobacterium. Detaljnija identifikacija izolata vršena je sekvencioniranjem dva konzervativna gena, gapA i mdh, primenom PCR metode sa parom prajmera gapA326F/gapA845R i mdh2/mdh4, tim redom. BLAST analiza je pokazala da svi izolati pokazuju 100% (gapA) i 98% (mdh) homologiju sa Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis sojevima deponovanim u NCBI bazi. Rezultati ovog rada ukazuju na postojanje nove podvrste bakterije Pectobacterium carotovorum u Srbiji, koja ranije, ukoliko je i bila prisutna, usled nedostatka filogenetskih informacija do sada nije bila identifikovana i opisana. PB - Društvo za zaštitu bilja Srbije C3 - XV SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova T1 - Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis – NOVI PATOGEN KROMPIRA U SRBIJI SP - 23 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1964 ER -
@conference{ author = "Popović, Tatjana and Marković, Sanja and Bijelić, Živojin and Iličić, Renata and Jelušić, Aleksandra and Stanković, Slaviša", year = "2018", abstract = "Fitopatogene bakterije iz roda Pectobacterium (raniji naziv Erwinia carotovora) na monokoti ledonim i dikotiledonim biljkama prouzrokuju bolesti tipa vlažne truleži. Osim ovog simptoma, za krompir je karakteristična i bolest opisana kao „crna noga” i uvenuće celih biljaka. U regionu Bačke (Vojvodina) je tokom maja 2018. godine na merkantilnom usevu krompira (sorta Lady Claire) zapa žena pojava crne noge krompira sa intenzitetom zaraze 5-10%. Već tokom juna intenzitet zaraze se povećao i iznosio je 40-45%. Početni simptomi bolesti su se ispoljavali u vidu uvelosti celih biljaka, dok se vršno lišće uvijalo prema licu i nekrotiralo po rubovima. Kako je bolest napredovala potpunim sušenjem vršnih listova i postepenim sušenjem donjeg lišća, na stablu je pri osnovi boja prelazila u mrku do crnu, a prilikom uzdužnog preseka mogla se uočiti nekroza unutrašnjeg sprovodnog tkiva. S obzirom na veoma izražen intenzitet zaraze, kao i veliki broj mogućih uzročnika koji izazivaju sličan tip oboljenja, cilj ovog istraživanja bio je detekcija i identifikacija prouzrokovača uvelosti i crne noge krompira. Izolacija patogena je vršena na hranljive podloge NA (hranljivi agar) i KDA (krompir-dekstrozni agar), iz biljnih delova (cima) dobijenih sa margina obolelog tkiva, potopljenih i maceriranih u sterilnom fosfatnom puferu, u trajanju od 30 min. Nakon 48 sati, na podlogama su se razvile okrugle i glatke, ispupčene, kremasto-prozirne bakterijske kolonije. Odabrani izolati su gram-negativni, nefluorescentni, fakultativno-anaerobni, oksidaza negativni, katalaza pozitivni. Pek tolitički test je izveden na kriškama krompira (25°C tokom 48 sati), na kojima je već nakon 24 časa dolazilo do propadanja tkiva uz prisustvo karakterističnog mirisa koji prati vlažnu trulež. Prema dobijenim rezultatima, izolati su pokazali pripadnost rodu Pectobacterium. Detaljnija identifikacija izolata vršena je sekvencioniranjem dva konzervativna gena, gapA i mdh, primenom PCR metode sa parom prajmera gapA326F/gapA845R i mdh2/mdh4, tim redom. BLAST analiza je pokazala da svi izolati pokazuju 100% (gapA) i 98% (mdh) homologiju sa Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis sojevima deponovanim u NCBI bazi. Rezultati ovog rada ukazuju na postojanje nove podvrste bakterije Pectobacterium carotovorum u Srbiji, koja ranije, ukoliko je i bila prisutna, usled nedostatka filogenetskih informacija do sada nije bila identifikovana i opisana.", publisher = "Društvo za zaštitu bilja Srbije", journal = "XV SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova", title = "Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis – NOVI PATOGEN KROMPIRA U SRBIJI", pages = "23", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1964" }
Popović, T., Marković, S., Bijelić, Ž., Iličić, R., Jelušić, A.,& Stanković, S.. (2018). Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis – NOVI PATOGEN KROMPIRA U SRBIJI. in XV SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova Društvo za zaštitu bilja Srbije., 23. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1964
Popović T, Marković S, Bijelić Ž, Iličić R, Jelušić A, Stanković S. Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis – NOVI PATOGEN KROMPIRA U SRBIJI. in XV SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova. 2018;:23. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1964 .
Popović, Tatjana, Marković, Sanja, Bijelić, Živojin, Iličić, Renata, Jelušić, Aleksandra, Stanković, Slaviša, "Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis – NOVI PATOGEN KROMPIRA U SRBIJI" in XV SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA Zbornik rezimea radova (2018):23, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1964 .