MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.)
Authors
Marković, Sanja
Mentor
Tatjana Popović MilovanovićSlaviša Stanković
Committee members
Tanja BerićOlja Medić
Renata Iličić
Doctoral thesis (Published version)

Metadata
Show full item recordAbstract
U Srbiji krompir ima veliki privredni značaj i pripada vodećim ratarsko-povrtarskim kulturama.
Tokom monitoringa sprovedenog od 2015 do 2019. godine, obuhvaćeno je preko 2000 ha useva
krompira sa 16 lokaliteta. Rezultati monitoringa su ukazali na prisustvo dve bakteriozne bolesti. Mrka
trulež krtola krompira utvrđena je u 2015, 2016. i 2018. godini i kao uzročnik je identifikovana
karantinska bakterija Ralstonia solanacearum. „Crna noga“ i vlažna trulež krtola krompira, koju su
prouzrokovale bakterije Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium brasiliense i Dickeya
dianthicola, detektovana je u 2016, 2018. i 2019. godini. U ovom istraživanju, prisustvo P. brasiliense
i D. dianthicola prvi put je zabeleženo na krompiru u Srbiji. Izolati R. solanacearum dobijeni iz 229
uzoraka sa mrkom truleži krtola bili su fenotipski homogeni, a na osnovu molekularno-genetičke
karakterizacije svrstani su u filotip II. Rezultati ispitivanja fenotipskih karakteristika izolata iz 50
uzoraka... sa crnom nogom i vlažnom truleži krtola ukazali su na postojanje uzročnika iz dva roda,
Pectobacterium i Dickeya. Međutim, molekularno-genetička karakterizacija ovih izolata ukazala je
na prisustvo tri vrste, pri čemu su P. brasiliense izolati bili heterogeni, dok su P. carotovorum i D.
dianthicola izolati uglavnom bili homogeni. Metabarkoding analiza omogućila je uvid u sastav
bakterijske mikrobijalne zajednice krtola krompira sa i bez simptoma vlažne truleži, kao i
odgovarajućih zemljišta ukazujući da razvoj vlažne truleži nastaje zbog složenih interakcija između
biljnih patogena i drugih endofitnih bakterija. Biokontrolna aktivnost Bacillus amyloliquefaciens
sojeva SS-12.6 i SS-38.4 prema izolovanim fitopatogenim bakterijama je dokazana u in vitro, in situ
i in planta uslovima.
Keywords:
Ralstonia solanacearum / Pectobacterium spp / Dickeya dianthicola / genetički diverzitet / metabarkoding / biološka kontrolaSource:
UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET, 2023, 1-141Funding / projects:
- Projekat Ministarstva prosvete, nauke i tehnološkog razvoja Republike Srbije III 43010
- Projekat Ministarstva prosvete, nauke i tehnološkog razvoja Republike Srbije OI 173026
Collections
Institution/Community
Institut za multidisciplinarna istraživanjaTY - THES AU - Marković, Sanja PY - 2023 UR - http://rimsi.imsi.bg.ac.rs/handle/123456789/1962 AB - U Srbiji krompir ima veliki privredni značaj i pripada vodećim ratarsko-povrtarskim kulturama. Tokom monitoringa sprovedenog od 2015 do 2019. godine, obuhvaćeno je preko 2000 ha useva krompira sa 16 lokaliteta. Rezultati monitoringa su ukazali na prisustvo dve bakteriozne bolesti. Mrka trulež krtola krompira utvrđena je u 2015, 2016. i 2018. godini i kao uzročnik je identifikovana karantinska bakterija Ralstonia solanacearum. „Crna noga“ i vlažna trulež krtola krompira, koju su prouzrokovale bakterije Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium brasiliense i Dickeya dianthicola, detektovana je u 2016, 2018. i 2019. godini. U ovom istraživanju, prisustvo P. brasiliense i D. dianthicola prvi put je zabeleženo na krompiru u Srbiji. Izolati R. solanacearum dobijeni iz 229 uzoraka sa mrkom truleži krtola bili su fenotipski homogeni, a na osnovu molekularno-genetičke karakterizacije svrstani su u filotip II. Rezultati ispitivanja fenotipskih karakteristika izolata iz 50 uzoraka sa crnom nogom i vlažnom truleži krtola ukazali su na postojanje uzročnika iz dva roda, Pectobacterium i Dickeya. Međutim, molekularno-genetička karakterizacija ovih izolata ukazala je na prisustvo tri vrste, pri čemu su P. brasiliense izolati bili heterogeni, dok su P. carotovorum i D. dianthicola izolati uglavnom bili homogeni. Metabarkoding analiza omogućila je uvid u sastav bakterijske mikrobijalne zajednice krtola krompira sa i bez simptoma vlažne truleži, kao i odgovarajućih zemljišta ukazujući da razvoj vlažne truleži nastaje zbog složenih interakcija između biljnih patogena i drugih endofitnih bakterija. Biokontrolna aktivnost Bacillus amyloliquefaciens sojeva SS-12.6 i SS-38.4 prema izolovanim fitopatogenim bakterijama je dokazana u in vitro, in situ i in planta uslovima. T2 - UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET T1 - MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.) EP - 141 SP - 1 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1962 ER -
@phdthesis{ author = "Marković, Sanja", year = "2023", abstract = "U Srbiji krompir ima veliki privredni značaj i pripada vodećim ratarsko-povrtarskim kulturama. Tokom monitoringa sprovedenog od 2015 do 2019. godine, obuhvaćeno je preko 2000 ha useva krompira sa 16 lokaliteta. Rezultati monitoringa su ukazali na prisustvo dve bakteriozne bolesti. Mrka trulež krtola krompira utvrđena je u 2015, 2016. i 2018. godini i kao uzročnik je identifikovana karantinska bakterija Ralstonia solanacearum. „Crna noga“ i vlažna trulež krtola krompira, koju su prouzrokovale bakterije Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium brasiliense i Dickeya dianthicola, detektovana je u 2016, 2018. i 2019. godini. U ovom istraživanju, prisustvo P. brasiliense i D. dianthicola prvi put je zabeleženo na krompiru u Srbiji. Izolati R. solanacearum dobijeni iz 229 uzoraka sa mrkom truleži krtola bili su fenotipski homogeni, a na osnovu molekularno-genetičke karakterizacije svrstani su u filotip II. Rezultati ispitivanja fenotipskih karakteristika izolata iz 50 uzoraka sa crnom nogom i vlažnom truleži krtola ukazali su na postojanje uzročnika iz dva roda, Pectobacterium i Dickeya. Međutim, molekularno-genetička karakterizacija ovih izolata ukazala je na prisustvo tri vrste, pri čemu su P. brasiliense izolati bili heterogeni, dok su P. carotovorum i D. dianthicola izolati uglavnom bili homogeni. Metabarkoding analiza omogućila je uvid u sastav bakterijske mikrobijalne zajednice krtola krompira sa i bez simptoma vlažne truleži, kao i odgovarajućih zemljišta ukazujući da razvoj vlažne truleži nastaje zbog složenih interakcija između biljnih patogena i drugih endofitnih bakterija. Biokontrolna aktivnost Bacillus amyloliquefaciens sojeva SS-12.6 i SS-38.4 prema izolovanim fitopatogenim bakterijama je dokazana u in vitro, in situ i in planta uslovima.", journal = "UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET", title = "MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.)", pages = "141-1", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1962" }
Marković, S.. (2023). MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.). in UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET, 1-141. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1962
Marković S. MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.). in UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET. 2023;:1-141. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1962 .
Marković, Sanja, "MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.)" in UNIVERZITET U BEOGRADU BIOLOŠKI FAKULTET (2023):1-141, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_rimsi_1962 .