MONITORING, IDENTIFIKACIJA I MOLEKULARNO-GENETIČKA KARAKTERIZACIJA FITOPATOGENIH BAKTERIJA KROMPIRA (SOLANUM TUBEROSUM L.)

Abstract

U Srbiji krompir ima veliki privredni značaj i pripada vodećim ratarsko-povrtarskim kulturama. Tokom monitoringa sprovedenog od 2015 do 2019. godine, obuhvaćeno je preko 2000 ha useva krompira sa 16 lokaliteta. Rezultati monitoringa su ukazali na prisustvo dve bakteriozne bolesti. Mrka trulež krtola krompira utvrđena je u 2015, 2016. i 2018. godini i kao uzročnik je identifikovana karantinska bakterija Ralstonia solanacearum. „Crna noga“ i vlažna trulež krtola krompira, koju su prouzrokovale bakterije Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium brasiliense i Dickeya dianthicola, detektovana je u 2016, 2018. i 2019. godini. U ovom istraživanju, prisustvo P. brasiliense i D. dianthicola prvi put je zabeleženo na krompiru u Srbiji. Izolati R. solanacearum dobijeni iz 229 uzoraka sa mrkom truleži krtola bili su fenotipski homogeni, a na osnovu molekularno-genetičke karakterizacije svrstani su u filotip II. Rezultati ispitivanja fenotipskih karakteristika izolata iz 50 uzoraka sa crnom nogom i vlažnom truleži krtola ukazali su na postojanje uzročnika iz dva roda, Pectobacterium i Dickeya. Međutim, molekularno-genetička karakterizacija ovih izolata ukazala je na prisustvo tri vrste, pri čemu su P. brasiliense izolati bili heterogeni, dok su P. carotovorum i D. dianthicola izolati uglavnom bili homogeni. Metabarkoding analiza omogućila je uvid u sastav bakterijske mikrobijalne zajednice krtola krompira sa i bez simptoma vlažne truleži, kao i odgovarajućih zemljišta ukazujući da razvoj vlažne truleži nastaje zbog složenih interakcija između biljnih patogena i drugih endofitnih bakterija. Biokontrolna aktivnost Bacillus amyloliquefaciens sojeva SS-12.6 i SS-38.4 prema izolovanim fitopatogenim bakterijama je dokazana u in vitro, in situ i in planta uslovima.